流程管理体系是研发项目运作和管理的手段。一个良好的流程管理体系能有效地提高项目运作效率、降低项目成本、控制项目风险等等。
例如，通过流程设计和优化剔除冗余环节和不必要的步骤，或者将项目的串行流程改为并行流程等措施将提高项目效率，加快项目进度；而通过在流程中建立适当的关键控制点可以充分地降低项目决策、管理和执行等方面风险。研发项目管理流程管理体系的建设，应当涵盖整个项目生命周期的主要管理要素，以保证对项目管理的全面和系统。如图2所示：
此外，为保证流程管理体系的有效运作，研发项目管理流程管理体系应当是规范化、结构化，以达到可管理、可控制、可衡量、易沟通、易分工和易评价的流程管理体系。
研发项目的组织和资源保证体系是项目运作和管理重要支撑，直接影响到项目运作的效率、成本和质量。尤其是项目的组织模式，是影响项目运作效率的重要因素。研发项目的组织模式一般采用矩阵式模式。现在比较推广的是以矩阵式为基础而衍发出来的IPD组织模式，如图3所示：
IPD的组织模式具有一定的优点，如：能够充分调动各个部门的技术力量和物质协助、能够提高各个部门的分工协作、能够更加关注整个研发流程的效率和效果等等，但同时，这种模式也存在不可忽略的缺点，带来管理上的一些问题，如：两个系统之间的平衡难以处理得当、责任的重叠容易引起部门之间的纠纷和考核的困难、渠道的增生容易引起信息的阻塞等等。
因此，在应用这种模式的时候，应注意以下问题：
●项目经理对研发项目的整个流程负责；
●对项目组人员的考核应该由两个系统的经理综合平衡考虑，分清考核项目和考核权重；
●费用的核算应按项目进行归集，按项目时间和任务划分进行成本的分摊；
●两个系统的经理在制订计划时要进行协商，对计划的调整和人员的变动要进行充分沟通；
●职能部门经理应在资源保障和技术支持上给予充分的配合，保证研发流程的通畅性和高效性，保证项目开发整个过程的质量。
项目管理是使跨部门团队集合起来更好地行动的关键。首先要有一个目标即项目所要达到的效果，一旦我们将客户的需求转换为对产品的需求时，就可以制定详细计划。该计划中的各部分将具体划分为每个职能部门的工作，即这个计划不只是研发部门的计划，也是公司各个部门共同的计划。一个产品从概念形成到上市期间会涉及到许多不同的紧密相联的活动，就好象不同职能部门彼此之间是有关系的。同样在一个项目中他们彼此之间的活动也是有关联的，所有的活动加起来就是整个的产品开发过程。
接下来就是活动的时间安排了，然后对每个活动进行预算和资源的调配，在项目实施过程中还需要不断地与计划对比，对计划进行必要的调整，在这里必须指出PDT做出的承诺不能改变。整个项目的进行过程都需要PDT的参与，PDT在产品开发整个流程中自始至终是存在的。管道管理类似于多任务处理系统中的资源调度和管理，指根据公司的业务策略对开发项目及其所需资源进行优先排序及动态平衡的过程。
绩效管理分项目绩效和人员/部门绩效。项目绩效果评价是研发项目管理的重要工具，它能通过高绩效项目的经验推广和项目绩效统计数据的变化等为研发项目管理体系的优化、调整提供重要依据。人员/部门绩效则可加强对项目的服务与监控，激发研发人员的积极性和创造性，提高员工的工作满意度和成就感，从而更好地完成企业经营目标。研发项目绩效评价指标体系的设计应当以研发管理战略为出发点，充分考虑项目特性、项目的组织模式等多方面因素。一般而言，研发项目的绩效评价指标包