设计标准引起超支;主要设备、建筑材料价格变动引起超支;管理不严格、质量问题返工的损失、浪费引起超支;设计变更、施工签证缺乏有效的约束，特别是重大设计变更和现场签证，普遍存在着手续不完备和“先斩后奏”的问题;概算中没有考虑难度施工系数，对前期拆迁、地下隐蔽工程等因素估计不足引起超支;项目审批和设计之间，设计与施工时间时间间隔过长，加重了材料、设备价格的变化对概算准确性的影响;有的项目开工后，因缺乏资金而停建、缓建，长期闲置，造成了大幅度超概算;概算编制质量不够高，部分设计人员迁就各方面不合理的要求，人为压低或抬高概算;概算定额修订滞后，难以满足施工项目的要求，给准确合理的计价带来一定的困难。
煤炭企业一般改造项目比较多，既要考虑充分利用原有设施，又要增加新的设施，考虑因数多，项目管理复杂，也给准确估计造成困难。因此，如何采取措施控制总投资不突破概算是项目管理中的一项重要任务。
3、 对项目前期论证工作重视不够
在项目管理过程中,普遍存在着重视项目建设轻项目前期工作的看法。项目前期管理中，对市场调研预测、技术工艺方案、投资规模缺乏认真的调查研究和仔细推敲。造成项目开工后更改、返工、甚至停工的情况，有的项目不经过批准立项，擅自开工建设，造成了巨大的经济损失。
据有关专家通过资料测算分析，建设项目在初步设计阶段，影响建设项目造价的程度为35%~75%，施工图设计阶段为5%~10%。由此看来，在初步设计阶段的设计概算是编制建设计划和控制施工图预算的依据，是考核设计的经济合理性建设成本的依据，也是限制"三超"的关键。因此加强项目前期论证工作对项目的成败起至关重要的重用。
4、 项目决策和管理失误追究责任制度不完善
国有企业投资一般采取领导集体决策，多个部门审查会签，有一套固定的业务流程，项目管理一般按照项目进度分阶段由多个部门分别管理，这样做目的是为了发挥了集体智慧，减少了投资失误。但是一旦投资失误，责任分别相应分摊，很难追究具体的责任。目前项目中延期、超支以及关、停、并、转的项目仍占一定比例，项目的经济效益急待提高。随着企业产权制度的改革不断深入，投资决策和管理失误追究责任机制有待于进一步完善。
5、 项目管理人员素质有待提高
每个项目都是一项系统工程，要求项目管理人员必须具备多门类的专业知识和相关知识，能够熟练运用项目管理知识，并经常对具体项目，深入实际，调查研究，这样才能保证设计方案符合实际，并有效控制概算。目前存在项目管理人员配备不齐全，水平较低，不能满足项目管理实际的需要，有待于调整充实。
四、提高项目管理水平的措施和对策
1、 完善项目管理和投资决策机制
在企业产权制度改革的新形势下，按照现代项目管理的要求，建立统一的项目开发与项目管理部门，以便对建设工程项目集中进行管理。进一步完善项目管理和投资决策制度。依据企业的发展战略和发展目标，建立企业项目库，大力开发企业支柱产业项目，避免项目在低水平上重复建设。扩大项目融资渠道，实行多元化项目投资。对重点项目实行追踪管理，提高项目管理效率，缩短项目周期，提高项目投资效益。
2、 加强项目前期管理工作
对于拟建设的工程项目，按照项目的归属性质