在技术管理风险、不可抗力破坏的自然风险。另一方面，目前，代建单位还要面对来自使用单位定位不明确的干扰风险，工程条件变化的工期延期风险，出现损失后的财务赔偿风险等。代建单位面对不断出现的工程质量和使用功能缺陷投诉、建设资金不到位、财务支付无法控制等诸多问题。
代建单位管理不善承担风险能力较弱。由于对代建单位资质管理不严，造成项目管理单位能力参差不齐，对项目代建单位的资信情况、承担风险能力管理较少，代建单位按照代建合同进行项目的投资控制，超过概算部分投资要代建单位自身承担，目前除10%履约保函外，对代建单位没有更多的风险承担能力要求，代建公司没有太多的资产，承担经济责任能力有限，若超过保函以外的风险，代建单位几乎承担不起，提高了政府承担项目代建单位管理风险的可能。针对代建制可能产生的风险，应加强政府投资项目风险控制和管理。
1 加强代建机构的培育，明确代建机构的资质要求。推行项目管理人员资质认证制度，不断增加代建机构数量，形成竞争的代建市场。建立有效的舆论监督和举报制度，确保队伍建设健康发展。
2 完善政府投资决策与监督约束机制。完善相关法律法规，对政府投资项目主管部门职责权限作出明确规定，建立多层次监管体系，完善政府投资项目合同文本。Blog.m
3实行工程担保与工程保险制度。代建单位应提供履约担保，政府在签订工程承包合同时，向代建单位提交支付担保，政府支付担保金额与代建单位的履约担保金额相等，解决承包商或代建单位的道德风险问题和逆向选择问题。
推行建设工程保险制度和工程风险控制制度，保险公司根据风险评估结果实行费率浮动；保险公司能够参与建设工程风险管理全过程，实现保险对建设工程风险的全覆盖，有效解决工程竣工后质量缺陷无保障的问题。创建代建单位管理责任险，促进代建单位提高自身管理水平。
政府投资项目的风险控制所承载的责任不仅是关系到项目成败，更是关系到公共利益，通过合理科学的风险管理推进整个项目的进程。国家建设的投资应从传统工作模式中拓展出新的思路，为提高政府投资经济效益和社会和效益，应重视分析和防范政府投资项目风险。
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