1． 需求信息的复杂性。与其他有些传统项目不同，信息系统要满足的诗人的主观需要。由于人的复杂性，给信息系统带来了无数的难以确定的因素。而且，随着项目的进展，许多具体情况的明确，项目的成本估算也会相应的有所变化。
2． 开发技术和工具的不断变化。开发工具软件的不断升级，技术方案不断更新，这些技术的进步让信息系统项目可以提供功能越来越强，但是给信息系统项目的成本估算带来困难。
3． 缺乏类似项目估算数据可供参考。有效的项目成本估算是建立在大量的同类项目的成本估算的基础上的。没有大量的同类项目的经验，信息系统项目的成本估算也就非常困难了。
4． 缺乏专业和富有经验的人才。
5． 信息系统研发人员技术能力的差异。不同人员的不同态度、经验和能力都会造成不同人员的截然不同的效率，这也给信息系统的成本估算带来了困难。
6． 管理层的压力与误解。
应避免的常见错误：
1． 草率的成本估算。由于市场和管理层的压力，项目组成员或者管理者被迫进行真正的准备的情况下作出成本估算。
2． 在项目范围尚未确定时就进行成本估算。在信息系统中也非常常见，往往是项目组对该做什么，不该做什么还只有一个粗略的概念时就要进行成本估算。
3.过于乐观或者保守的估算。过于乐观的估算会给项目带来压力。保守的估算可能会使决策者放弃本来有利可图的项目。
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