随着京东、当当等各种独立B2C的全面崛起，淘宝受到了前所未有的威胁。中国最大的假货市场被扣在头上，已是淘宝网不能承受之痛。如果痛下杀手，又被中小卖家指责背信弃义过河拆桥。
但马云却是宁可被指“过河拆桥”，也要痛下杀手。在众多的淘宝商家组成联盟对淘宝商城发动攻击之时，他仍在微博上称：“还会一意孤行，因为我们相信自己的决定，我们做了最该做的事。”
作为平台，淘宝商城有权通过提高收费标准的方式来促进市场优胜劣汰，但从网上评论看，多数观点还是不赞同淘宝商城的鲁莽行为。
“面对网商行业的新趋势，淘宝更应该做的，是利用自己的实力，帮助中小卖家尽早实现转型，与自己共同成长，而不是找一些借口让他们出局。”博盖咨询总经理高剑锋表示，这涉及的是商业道德的问题。B店是未来电子商务的趋势，已是业内共识。淘宝欲从C2C转向B2C，并借此清理中小卖家，在商业逻辑与法律方面都没有问题，却独独缺了个“情”字。双方本应是一个战壕的战友，但如今却成为对立的两面。如果这些中小卖家最终大批投奔淘宝商城的竞争对手，可能会让马云更加尴尬。
而在另一位不愿具名的电商行业分析师看来，此番淘宝商城与卖家的对立事件，也反映出我国电子商务行业服务标准缺失的问题，导致平台商在这场游戏中既当运动员又当裁判员，可以恣意的修改规则。
但马云显得很无奈——
10月19日，商务部新闻发言人沈丹阳在例行新闻发布会上坦言：“这次事情发生的根本原因主要是因为目前我国网络管理的法律基础薄弱，网络零售领域法律缺失、监管体系不完善。因此，我们认为应该加快网络零售法律管理体系建设，当前要推动建立《网络零售管理条例》，由商务部牵头起草，尽早出台。”
“对于电子商务规则问题，阿里巴巴曾经跟各种主管部门沟通，可惜都没有什么结果。”马云对媒体表露。
对于马云而言，2011年颇多意外之事。年初香港上市公司阿里巴巴“中国供应商”造假丑闻爆出，从而造成上市公司CEO卫哲引咎去职。而支付宝股权转移这一桩事，马云从中国商业世界最大的明星成为备受争议的“背德者”。随后就是淘宝商城新规引发的小卖家围攻商城大卖家的风波。此事明眼人一看即是阿里巴巴占据道理的上风，但是却被有意无意引申为“淘宝原罪”和马云“卸磨杀驴”之说，因此颇让马云恼火也在意料之中。
此前无论是马云还是淘宝商城总裁张勇都异常坚决，表示要坚定不移地推行新规，但外界传言商务部的表态让马云和淘宝商城不得不让步——毕竟后来出台了“妥协措施”。但只要往后退一步，这个公司的定位与战略也就打了折扣。
而且，阿里巴巴集团旗下公司阿里巴巴、原淘宝和支付宝任何一家如果是单独公司，都称得上巨头。巧的是，这三家公司在2011年偏偏各出一事，而每一件事情引发的危机，都需要集团CEO马云出面来凭借个人魅力收拾残局，甚至赔上的也是个人荣誉——所有的冷嘲热讽大都是冲着马云，讥笑他如何将自己神化，却又名不符实。
在10月17日新闻发布会的现场，马云没有直奔主题，而是一如既往的运用强大的感情攻势开始自己的演讲。比起以前的条分缕析、激情洋溢，马云这一次演讲显得有些低落，他反复提及“以后跟大家交流的机会会越来越少”，这甚至让外界联想到他是不是已有隐退之意。
中插：
柳传志：
对入驻商家设门槛剔除个别不好的商家，提高淘宝商城的品质是对的。但是马云在方法上有欠妥当，应该在保护小商家积极性的前提下，在让大家都支持的情况下再将个别不好的人踢出去。