国际化，会从研发人才，研发资源，产品市场等方面对东道国产生冲击。人才方面，跨国公司正逐渐实现人才本土化.其用人策略也发生了很大转变.不仅用高薪从本土企业和科研院所招聘科研人才，还直接去国内高校招聘优秀的应届大学毕业生。跨国公司研发机构通过给予良好的工作环境和发展空间吸引了大批的我国科研人才，严重地削弱了我国研发机构的研发力量。资源方面，跨国公司在华研发国际化吸走了国内稀缺的研发资源，加剧了我国技术依赖。国内部分保密技术的泄露，使在竞争中部分水平较低的研究开发机构面临倒闭的可能。这些使得我国的战略研发资源流失严重，进一步削弱了我国自主创新研发能力，更可能使我国产生对跨国公司研发机构的技术依赖。市场方面，跨国公司在华研发国际化控制了部分国内市场。跨国公司通过开发适合我国市场需求和消费者偏好的产品，极大提高了消费品的市场占有率，赢得了大量的国内消费者，使国内产品市场面临严峻的挑战。
例如由于缺乏核心技术，自主创新方面我国许多企业以及行业都处于不利的地位，我国的 电子 信息产品，如彩电， 计算 机，DVD和手机中核心技术的知识产权多数不在我国企业手中。在DVD57项关键技术中，我国企业掌握的只有9项，还都是非核心技术。医药行业，一些医药厂家生产的生物医药没有自主知识产权，而世界各国又因为生物制药的高科技含量和高附加值，都加大对生物制药的保护力度，缺乏自主只是产权已经成为严重制约我国生物制药产业发展的瓶颈。
因此，中国必须正视外资研发机构的发展和影响，大力加强中国企业的研发能力和自主创新能力，掌握行业发展的核心技术，这样才能使中国企业在世界范围内的竞争中立于不败之地。
二、跨国公司R&D全球化与我国的创新体系
随着只是生产和 经济 关系的日趋密切以及创新活动的日益复杂，创新被看作是一个复杂的系统，其理论研究也不断深入，范围不断扩展。创新不是单纯的由新的知识转换成新的产品的过程，而是个人，机构和环境之间进行复杂互交作用的结果。一个国家在技术创新的国际化竞争中的实力，主要取决于两个方面的因素:一是国内技术市场机制的完善和发达程度;二是国家在推动国内创新与参与国际竞争中的决心和作用。对于 发展 中国 家来说，更为如此。面对跨国公司研发的一体化和国际竞争的新格局，我国的创新体系虽然在改革开放以后初具规模，但是其创新效率还不高，存在许多问题。
(一)我国创新体系中存在的问题
第一，我国整体研究与开发支出占国内生产总值的比重偏低。
第二，作为创新主体的 企业 ，研究与开发投入的强度不够。研发经费投入不足是目前中国企业技术创新的软肋，创新的组织机构也不完善，多数企业没有形成自己的核心技术能力。相关资料表明，目前我国大中型企业中71%没有技术开发机构，2/3没有技术开发活动。大中型企业的研发经费只占销售的0.39%，即使高新技术企业也只占0.6%。根据国际经验，技术研发投入占销售额比例在1%以下的企业是难以长期维持的，比例为2%左右的企业仅可以简单维持，只有比例在5%的企业才有核心竞争力。[10]第三，在科技创新方面，科研产出在量和质上不高。虽然我国科技人力资源总量很大，研发人员数量多，但是企业多年来没有建立起技术创新的主体地位。我国企业引进国外技术资源的依赖程度比较高，在关键技术的自给率低，对外依存度在50%以上(美国日本在5%左右)。目前我国以引进国外成套设备和生产线为主，专利和专有技术引进不足， 国有企业在技术引进之后，存在的另一个问题是没有充分的对引进的技术进行消化吸收和再创新，形成自己特色的技术体系。实现引进→创新→输出的良性循环。
第四，国家创新体系中各子系