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研发项目管理与研发经费核算是紧密联系的，企业的科技管理部门与财务部门的衔接至关重要。为了配合财务部门对研发经费核算工作，科技管理部门就需要对原有工作流程、环节等进行相应的调整，才能为财务部门提供足够的进行会计核算的信息；为了支持科技管理部门的研发项目管理，财务部门就需要及时提供项目经费使用情况，才能帮助科技管理部门进行研发项目的经费管理等。
1 研发项目管理方面的改进
(1)研发项目上报时间的要求。财务部门对研发经费的核算完全基于研发项目，这就对研发项目的立项管理提出了更高的要求。必须对研发项目上报时间有严格的要求。要尽可能早的在年初把技术开发项目清单提供给财务部门，满足财务部门项目管理系统初始化的需要。一般每年公司都会有一些追加项目，在追加项目立项后要尽快把项目名称、编号等提交财务部门。并让财务部门及时补充进财务系统，保证项目启动后发生的相关费用能正确核算进该项目。
(2)研发项目立项任务书的规范。研发项目立项任务书是研发经费核算的依据。因此企业在编制研发项目立项书时必须提供以下内容：
①项目的内容：项目的内容主要体现该项目的技术路线、技术创新点、研发方法及社会经济效益等，这是界定该项目是否为研发项目的依据。
②项目周期：即项目的开始和结束的日期，项目周期主要界定了项目所用到的设备的折旧期限。
③项目参与人员：项目参与人员包括专业研发人员及非专业研发人员(如借调生产线工人进行小试、中试等)，项目参与人员的确定为研发经费中的人工费提供了依据。
④项目所用到的仪器设备：项目所用到的仪器设备包括专门用于该项目的研发设备和通用的仪器设备。在项目周期内，专门用于该项目的研发设备的折旧额可以全部计入该项目的研发经费；而通用的仪器设备可能用于多个项目，因此只能把某—个项目占用该仪器设备的时间内的折旧额计入该项目的研发经费。
⑤项目的经费预算：项目经费预算应包括经费总预算表与经费明细预算。经费总预算是该项目总的预算额，而经费明细预算则是对总预算的细化，应主要包括：研发人工费、研发设备折旧、研发机构办公费、直接材料费、研发人员差旅费、研发交流费、中间试验费、图书资料费、委外科研费、其它与研发相关的费用等。
(3)研发过程中的相关流程改进。财务部门在对研发经费进行核算时，必须要以研发活动相关的业务单据为依托。如果研发部门工作不到位，没有在原始凭证E正确标示}n是否是研发费，财务人员入账时就无法正确计人研发经费相关科目和项目里，导致研发经费核算不完整。因此，为配合研发经费的核算与统计，要求研发部门在开展研发项目的过程中需要进行相关的调整与完善。
(4)研发项目立项书的统一管理。研发项目立项书应有企业技术中心或研发中心的科技管理部门统一管理，避免造成企业研发项目的分散，从而容易产生低水平的重复开发或创新资源的浪费或者配置不足的情况。为了达到这一目的，企业需要在赋予科技管理部门该职责的同时，也须给予科技管理部门相应的权利，如研发项目经费审批权、研发项目过程监控权及研发项目成果验收评审权等。
同时，科技管理部门应该将所有研发项目进行科学的编码管理，将科研项目按其分类内容加以有次序之编排，用简明之文字、符号或数字，以代表科研项目的名称，规范及其它有关事宜的一种制度，尤其计算机化之数据处理更需借助编码统一管理科研项目以达事半功倍之效果。
2 研发经费核算方面的改进
(1)研发经费相关概念的规范与标准的确定。要对研发支出进行科学合理的核算与统计，首先必须对研发经费的概念有明确的认识。有效区分研发项目与其他生产项目。把属于研发类的项目科学界定出来
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