所谓两级控制成本管理，即为企业级与项目经理部级对项目实施的成本管理，它是项目成本管理的核心问题，同时也是一个复杂的涉及到多方面的问题。如何科学有效的解决在两级控制项目成本管理中遇到的实际问题，就需要对现有成本管理体系特点的全面深入认识和对现代项目管理对成本管理核心要求特征的深刻了解，通过不断的分析、实验、总结、提升，逐步创建既考虑原系统状况又满足新体系要求的新模式新方法。
对企业来说最主要的问题是项目成本控制不了，尤其是在竞争日趋激烈的情况下，它直接导致企业产值利润率每况愈下、流动资金匮乏、“没活活不了，有活难赢利”等现象出现，企业生存举步唯艰。本文基于现代项目管理的理论与实践，总结实际中遇到的管理问题，并试图提出问题解决方案，探讨现代项目成本管理可采取的模式和途径，解决企业在此类成本管理中遇到的困惑。
不少企业曾想了很多办法试图解决成本管理问题，如提倡“先算后干，边算边干” 、加强成本管理做到“成本管理要做到月近似，季差小，年准确” 、提出“不能赢利的项目经理不能再任职” 、“增加风险抵押金” 、“成本是企业的第一要务，具有第一否决权” 、更有一些单位采取“企业一律先留下合同金额的′′%的管理费，剩下的项目用” 、也有的企业指望“制订新版各系统项目管理办法”来解决问题，采取的组织措施也不少，如为了避免利润的流失，采取“收权”的措施，即一切材料采购权、机械设备租赁权、劳务与分包合同签订权均由公司掌握。在统的过程中又遇到资金短缺，运转不灵，反应速度慢等问题，于是又再一次“放权”。“放权和收权”各种办法交替使用……，由于不是从整个系统上解决问题，又拿不出解决成本管理每一个过程的详细管理方法与手段，因而很难从整体和根本上解决问题。
近年来对一些工程项目的成本管理进行了比较系统的定量分析研究表明：传统的项目成本管理对成本过程控制不了，不少项目经理部月度都盈余，最后赔钱。其中项目成本过程控制不了是指，成本形成过程中无法发现差异的产生，也无法提出应有的警示，更难于实时地采取应对的措施。不能干预成本形成过程、不能采取实时措施去降低成本是落后传统成本管理的致命要害。两层管理模式下的项目成本管理所谓两层管理模式是指：企业?项目经理部管理模式，从上流程可见，成本的过程控制涉及比较基准、数据归集、偏差分析、采取措施和数据积累等诸多内容。这种大规模的数据实时处理，必须借助计算和相应应用成本管理软件，项目经理部的工程管理人员具有相应技术管理技能和计算机应用软件操作技能是完全必要的。
另外需明确的说，项目成本控制是项目综合管理的体现，现代项目成本管理应作到COA（Cost On Activity）基于工序的成本管理水平，真正起到降低成本，获取最大利润的目的。具体讲COA就是以进度计划为主线，把资源分配到工序上，做到成本工序级的管理，应该指出的是，编制切实可行的进度基准计划是目前大多数企业的弱项，但从技术上讲完全可以做到，下图引用的资料是1992年北京市某重点工程的实际资料，在此资料中，在进度计划中已把资源分配到工序上。 这种管理细度通过WBS（工作分解结构）确定，国外有一些现成的模板可供参考，国外编码体系健全，规定明确，这方面我国尚有差距，但目前这项工作在进行中，如我国由2003年7月1日实行的建设工程工程量清单计价规范实行统一编码，将有力地推动我国编码体系的建立。
在计划实施时，要不断地将计划成本与实际成本进行比较，进行偏差分析，找出发生偏差的原因，及时采取措施，改进生产，降低成本。这种做法正是强调了反馈作用，抓住了成本管理的目的：降低成本