从全面质量管理到IS09000再到现在的60管理，企业在不断探索中希望获得一个有效的QMS，但由于对某些深层因素没有很好地把握，导致不少企业的QMS存在缺陷而难以达到预期的运行效果。 QMS运行中普遍存在的缺陷主要表现在：
l 忽视培植体系运行的文化土壤：
企业依据某种模式(比如IS09000族国际标准)建立QMS时，如果处于浅层的、被动的而不是深入的、主动的状态，那么建立起来的QMS很容易与模式倡导的思想发生偏离。当其结果达不到预想的效果时，企业管理层便容易对QMS建立的依据产生怀疑，由于缺乏深度的检讨，管理层很容易丧失信心，从而导致企业QMS处于无所适从的紊乱状态。其实任何一种模式，如果不深刻理解它蕴涵的思想，并努力培植适合这种模式运用的管理土壤和文化状态时，再好的模式也很难发挥应有的作用。
改进建议：(1)企业管理者要有长远的、战略性的眼光，从改造企业的思想或者文化状态人手，首先明确制度管理是贯彻IS09001国际标准的关键，也是QMS有效运行的基石和准绳。(2)导人“诚实、诚信”思想，即从管理层带头，企业QMS运行的各个过程和环节完全依照企业的各项规章不折不扣地执行。(3)企业管理者必须逐步依靠规章去建立一个具有企业自身特色的质量文化，文化的建立是一个需要“耐心”的过程，不能因为管理者个人身份的变更而导致文化形态的变更，否则企业永远不可能建立属于自己的文化特征。(4)企业管理者应潜心研究企业的质量战略目标，并寻找实现这个目标所需要的、最适合企业的手段和方法，要明白任何一个管理模式必须结合企业的内外环境有机实施和推行，重要的并不是工具，而是培植使这个工具充分发挥作用的文化土壤。
2 管理职责履行不到位：
就现状而言，不少企业的QMS管理职责还未完全履行到位，具体表现是：不同层次的管理者对文件化的QMS及其过程对本部门提出了什么要求，赋予了什么职责与权限，应该如何履行这些职责与权限不甚明白，因而无法把质量职责进行有效分解、展开和落实。特别是某一过程或活动的主要负责部门与协办部门在履行某项质量职能时，往往不能把责任和活动的接口界定清楚，导致相互间的工作配合和沟通不力，出现问题时互相推诿。
改进建议：(1)企业管理者应做履行QMS质量职责的“明白人”和“带头人”。各级管理者要明确在整个QMS过程中自己处于什么地位，应执行的质量职责是什么。管理者要以身作则，全力完成所负责的质量职能／质量活动，成为认真履行质量职责的榜样，并带动下属及相关人员圆满地履行质量职责。(2)各级管理者应为与本职有关的过程、层次和部门的质量职能／质量活动提供履行QMS要求的指导性文件和评价准则。(3)强化自上而下的监督管理和自下而上的信息反馈机制，及时沟通QMS的运行态势以及各层次、各部门、各岗位的业绩与问题，针对发现的问题采取纠正和预防措施。
3 制度管理的根基不牢：
QMS体系运行的支撑是制度管理，制度管理必须建立在一个合理、规范、严格的基础上，必须得到企业各级管理层的充分理解和支持。目前，不少企业的QMS制度管理至少还存在以下缺陷：(1)制度所定的程序操作性不强。如不少管理程序，尤其是涉及多个部门接口关系的程序，规定不细致，接口不清晰，流向不顺畅，导致执行困难。此外，不少工艺和检验文件规定粗糙，与实际脱节。(2)程序规定不完整。许多环节由于缺少有效版本的管理程序，往往依照领导或当事人的意愿行事，当领导或当事人变更时，使得后继者无所适从，“另起炉灶”，造成管理上的随意性。(3)程序执行不到位。个别管理者对程序研究宣贯不够，或者