根据流程的方法论，在设计研发项目流程之前，我们必须先确认研发相关的功能单位以及单位间的运作模式。研发流程的负责，主要来自于各种功能单位形成复杂的运作模式所造成，因此我们说明一下研发相关单位的组织结构。
从组织的角度来看，除了研发部门之外，还有制造部门、品管部门、资材部门、业务部门、采购部门、仓储部门、信息部门、财会部门等参与产品开发的项目，若以功能性质来划分，可能有20个以上的单位。由于每个部门/单位参与的性质及程度皆不同，为了方便读者的了解，同时作为分析营运模式的基础，我们依据各部门项目的特性，将各个单位先予以分类。基本上我们依据研发项目的特性，将所有的部门分成四种单位：
●管理单位：执行管理与控制的职能；
●接口单位：负责跨部门、单位沟通协调的工作；
●技术单位：为产品开发所需各类专业技术单位；
●辅助单位：非专业技术性，在产品开发过程当中提供支持，而且以行政性质的项目为主。
以计算机制造业为例，所有的部门及单位大致上可归到以上四类：
1、管理单位
——总经理：负责所有产品的收入、成本、与获利；
——研发经理：负责所有的研发工作；
——项目经理：负责个别产品开发项目的进度及成败；
——研发单位主管：负责产品开发中，个别专业技术项目及人员的管理；
——其他部门主管：负责产品开发过程中，所提供的支持项目；
——产品审议小组：负责审核产品的质量，决定开发项目是否完成。
2、接口单位
——PE单位：负责制造部门与研发单位之间的沟通；
——文管单位：负责研发相关文件资料的收集、整理、保管、发行；
——助理单位：负责部门间沟通传递与联络事项；
——业务单位：负责协助技术单位与客户之间的沟通。
3、技术单位
——计划单位：负责将客户需求转成产品规格、展开工作计划以及项目进度的控制与协调；
——硬件单位：负责线路设计、组件配置设计；
——软件单位：负责程序撰写；
——产品宣传单位：负责产品的功能说明及使用手册；
——机械单位：负责设计机构；
——样品单位：负责制作样品；
——BIOS：负责设计输出/入接口；
——EMI：负责处理电磁波。
4、辅助单位
——BOM：负责建立及维护料件清单以及料件编号；
——料件单位：负责新料件确认工作；
——测试单位：负责产品测试工作；
——物料控制仓库：负责提供库存零件数量信息；
——物流单位：负责运送制作样本所需的零件；
——采购单位：负责与供货商接洽零件采购的价格、数量、及供应时间；
——产品技术原厂单位：提供新组件技术信息；
——形象设计单位：负责设计产品的包装；
——财务单位：负责计算产品成本；
——信息管理单位：负责信息方面工作的支持。
研发运作模型
将参与研发项目的功能单位依其性质分类之后，我们可籍由绘制运作模型，来明确各单位之间的关系，并初步分析这样的分工及协调方式是否合理。以下是一个部分而简易的研发运作模式。
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