创新项目风险识别和度量完成以后，人们还需开展创新项目风险应对措施的制定。所谓创新项目风险应对措施，就是指在创新项目风险发生之前、之中和之后人们所应采取的各种对应的管理措施。关于人们何时采用哪种创新项目风险应对措施的计划安排，就构成了创新项目风险应对的计划。
通常，创新项目风险应对措施主要有两种：其一是消减或转移创新项目风险损失的应对措施;其二是增加或抓住创新项目风险收益的应对措施。创新项目风险应对措施主要包括以下几种。
1、创新项目风险容忍措施
这种措施是针对那些发生概率很小，而且风险所能造成的后果较轻的创新项目风险，人们所采取的一种创新项目风险应对措施。这是一种最常使用的创新项目风险应对措施，但是由于不同创新组织的风险容忍度不同，所以先要合理地确定组织的风险容忍度。
2、创新项目风险规避措施
对于不能够容忍的创新项目风险，特别是风险后果十分严重或关联影响十分严重的出校门项目风险，这人们必须借助放弃创新项目或放弃使用有风险的创新项目资源、技术、设计方案等创新项目风险规避措施，从而规避开创新项目风险不利后果的一类应对措施。
3、创新项目风险分担措施
对于人们既不能容忍又不能规避的创新项目风险，人们就需要使用创新项目风险分担的应对措施。这是指根据创新项目风险的大小和项目相关利益者承担风险的能力大小，分别由不同的创新项目相关利益主体合理分担创新项目风险的一种应对措施(如合同分包)。
4、创新项目风险转移措施
对于既不能容忍又不能规避，并且也无法进行分担的创新项目风险，人们可以通过购买保险等方法将创新项目的某些风险转移给保险商(或他人)，这种措施就属于创新项目风险转移措施。这类创新项目风险应对措施只在保险业比较发达的国家使用。
5、创新项目风险遏制措施
这是从遏制创新项目风险引发原因的角度出发，去应对创新项目风险的一种措施。例如，对可能因创新项目财务状况恶化而造成的创新项目风险(如因资金断绝而造成创新项目失败等)可采取注入新资金等措施，就是一种典型的创新项目风险遏制措施。
6、创新项目风险化解措施
这类措施从化解创新项目风险产生原因出发，去控制和消除创新项目具体风险的引发原因或条件，从而实现成功应对创新项目风险的目的。例如，对于可能出现的创新项目团队的各种冲突风险，就可以采取沟通和调解方法去化解。
7、创新项目风险消减措施
这类创新项目风险应对措施主要是为应对无预警信息的创新项目风险，以及在创新项目风险后果发生阶段所采取的应对措施。例如，当创新项目实施中发生各种意外事故的时候，人们采取的救火或救人的措施就是一种创新项目风险消减的措施。
8、创新项目风险储备措施
这也是为应对无预警信息的创新项目风险及在创新项目风险后果发生阶段所采取的一种创新项目风险应对措施，特别是对于人力不可及的创新项目风险，人们都应该采取这种创新项目风险应对措施，这包括储备资金和储备资源等方面的措施。
9、创新项目风险开拓措施
当组织希望提升创新项目风险带来的收益或机会的时候，人们就需要采用这种积极开拓的创新项目风险应对措施。这种应对措施包括为创新项目分配更多和更好的资源，以便借此抓住机遇和提升创新项目风险收益。